百塔寺位于終南山北麓長(cháng)安區王莊鄉天子峪口，地勢高敞，視野遼闊。東眺五臺翠華，群峰聳立；西覽草堂煙霧，灃水碧濤；南依巍巍秦嶺，林木蔥郁；北視關(guān)中平原，沃野千里。正所謂龍脈龜背，風(fēng)景絕佳，隋唐時(shí)期即為佛教僧侶修行之道場(chǎng)。

百塔寺始建于西晉太康二年(281)，原名淳化寺。隋開(kāi)皇十四年(594)復建，稱(chēng)至相道場(chǎng)。因三階教創(chuàng )始人信行禪師圓寂后葬于寺院附近，故又名信行禪師塔院。是隋、唐佛教三階教的祖庭。唐大歷六年771)改名為百塔寺。百塔寺在隋、唐時(shí)期盛極一時(shí)，規模巨大，殿宇宏偉，寺僧眾多，占地千畝，有“騎馬關(guān)山門(mén)”之美譽(yù)。宋時(shí)百塔寺之規模猶存。之后寺院不斷衰敗，到了明代時(shí)期百塔就所剩無(wú)幾了。

清同治元年(1862年)，南山一帶諸多寺院均毀于戰火，百塔寺亦未能幸免。民國初年，該寺殘墟猶存，規模已大不如前，只留下北門(mén)城樓(即山門(mén))垣墻、古槐、照壁依然可觀(guān)。殘垣內存殿堂三座，皆五開(kāi)間，名禪興堂、德道堂、十方道場(chǎng)。寺院后有藏經(jīng)樓，另有僧舍六十余間，當時(shí)寺院住持為心開(kāi)和尚。院內外有唐槐四株，重達兩千余斤的鐵鑄古洪鐘一口，直徑四尺的黑鐵鍋兩口，枝繁葉茂的參天銀杏樹(shù)一株，寺西有方形五級磚塔一座，直插碧空，獨立終南。在寺之東南山下有塔院四十余畝，俗稱(chēng)“尚人墓”，存大小石塔數十座。

民國三十年(1941)前后，國*民黨黃埔軍校第七分校駐扎在王曲曹村一帶。為了修建軍隊營(yíng)房，將百塔寺大殿廟宇大多拆毀，法器什物搶劫一空，伐樹(shù)毀像，寺內之古鐘、大鍋、名人壁畫(huà)、經(jīng)幢毀之凈盡，蕩然無(wú)存。

百塔寺自晉代開(kāi)始即成為游覽勝地，歷代名人多有訪(fǎng)游。東晉王羲之在此寫(xiě)過(guò)《心經(jīng)》石碑，碑現存西安碑林內。北宋蘇軾游覽南五臺諸寺及草堂寺、太平峪時(shí)，曾止宿于此寺。明趙、清王弘度都作過(guò)《百塔寺》詩(shī)抒情詠懷。寺內現存有刻于唐貞觀(guān)五年(631)的《化度寺故僧邕禪師舍利塔銘》，總章三年(670)的《道安禪師塔銘》及立于開(kāi)元四年(716)的《太常協(xié)律裴公妻墓志》等碑銘。大殿后的銀杏樹(shù)，相傳為隋、唐時(shí)栽植，被稱(chēng)為“中國第二銀杏樹(shù)”、“千年活化石”，高約30余米，樹(shù)冠達百余米，樹(shù)圍18余米，濃蔭覆蓋半個(gè)寺院。銀杏樹(shù)歷盡千年風(fēng)霜，依然枝葉茂盛，長(cháng)勢見(jiàn)旺，1998年西安市公布為重點(diǎn)保護文物。1999年日本三階教研究專(zhuān)家西本照真大師蒞臨百塔寺，稱(chēng)贊說(shuō)“此樹(shù)是三階教興衰的活見(jiàn)證”。最后一次修復百塔寺是在1986年，隆和老和尚帶領(lǐng)僧眾弟子，建起了現在規模的百塔寺。